En tiempos de cosecha de la espiga del maíz, la empresa tiene convenios para entregar chala y marlo para alimentación animal y como fuente de energía.  Además, dentro del cluster de la semilla, Nidera junto a otras empresas del sector y la municipalidad de Venado Tuerto, está trabajando en un proyecto de generación de energías alternativas a partir de los subproductos de la industria de la semilla.

A su vez, en la planta de Nidera Junín se genera energía eléctrica utilizando como combustible la cáscara de girasol que se separa en la producción de aceite. Gracias a dicho proceso, la planta genera el 75% de la energía necesaria para procesar girasol y soja.